IBM, Mayo Form Open-source Health IT Consortium

Biomedyczni informatycy w IBM a Klinika Mayo uruchomiła nowe konsorcjum open source koncentrujące się na przetwarzaniu języka naturalnego (NLP), aby pomóc lekarzom w dzieleniu się informacjami na temat diagnozy i leczenia.

Ogłoszone w czwartek konsorcjum Open Natural Language Processing skupi się na: technologia pozwalająca na agregację danych na dużą skalę, umożliwiająca lekarzom wydobywanie dokumentacji medycznej z ich specjalności w celu znalezienia podobnych przypadków do badania przed postawieniem trudnych diagnoz lub przed określeniem leczenia.

Lekarze będą mogli przejrzeć notatki lekarskie dotyczące podobnych przypadków, ale w bazie danych nie będą dostępne żadne informacje umożliwiające identyfikację pacjenta - poinformowały IBM i Mayo.

Wraz z uruchomieniem konsorcjum obie organizacje wydały dwa projekty w ramach open-sourc licencje, jedna dotyczyła uwag klinicznych, a druga raportów dotyczących patologii. Konsorcjum korzysta z licencji Apache w wersji 2.0.

Organizacje zapraszają innych do pomocy w opracowaniu narzędzi NLP. "Robiąc z tego inicjatywę typu open-source, mamy nadzieję, że umożliwi to szerokie zastosowanie tych narzędzi NLP, aby postępy medyczne mogły przebiegać szybciej i bardziej efektywnie", powiedział dr Christopher Chute, ekspert w dziedzinie bioinformatyki Mayo Clinic i starszy konsultant w tej dziedzinie. oświadczenie.

Dwie inne organizacje opieki zdrowotnej, Seattle Group Health i Departament ds. Weteranów USA Boston Healthcare System, planują wziąć udział w konsorcjum, a inni uczestnicy są mile widziani, powiedział IBM i Mayo.

Jak więcej zdrowia Dostawcy usług opieki zdrowotnej przyjmują elektroniczne rejestry medyczne, coraz większe znaczenie będzie mieć możliwość przeszukiwania tych zapisów, podały organizacje. Mayo i IBM opracowali system wyodrębniania informacji z ponad 25 milionów notatek klinicznych opartych na tekście, opartych na otwartej architekturze IBM - Unstructured Information Management Architecture lub UIMA - powiedzieli.

Obie organizacje opracowały także system do ekstrakcji charakterystyka chorób nowotworowych na podstawie raportów patologicznych, pozwalająca na obliczenie stadium raka.

"Ekstrakcja informacji na dużą skalę z narracji klinicznej jest kluczowym elementem w rozwoju badań translacyjnych i opieki nad pacjentem," Guergana Savova, specjalista ds. informatyki medycznej i Mayo's prowadzić do projektu, powiedział w oświadczeniu. "To" odblokowuje "kliniczne dane tekstowe, które znajdują się w ogromnych repozytoriach, a taka technologia umożliwiłaby agregację, analizę i wykorzystanie danych na dużą skalę - wystarczy wyobrazić sobie moc danych pochodzących od milionów pacjentów."

Organizacje nie jednak zdecydował, co projekty NLP do pracy na następny, powiedział rzeczniczka IBM. "Celem jest uzyskanie informacji zwrotnej od uczestniczących instytucji na temat początkowego projektu, a następnie rozwinięcie", powiedziała.